尹恩惠1999年,15岁的尹恩惠被选入女子偶像组合Babyvox,并以组合第三张专辑《comecomecome》正式出道。2004年,尹恩惠成为SBS节目《X-MAN》的固定嘉宾。2005年,完成处女作电影《圣诞出逃记》。2006年,与朱智勋等主演根据同名漫画改编的水木剧《宫》获MBC大赏“最佳新人演员奖”,还首次挑战乡村清新爱情题材KBS的《葡萄园的那小伙儿》,凭借该剧获得“韩国2006格莱美奖最佳女主角”。2007年,与孔刘等主演的爱情剧《咖啡王子1号店》,并于次年4月24日,凭该剧获得第44届韩国百想艺术大赏电视最佳女演员。2009年8月,她主演的韩国KBS电视台水木连续剧《拜托小姐》开播,尹尚贤,尹恩惠,金素妍凭该剧获得2009年度KBS演技大奖人气奖,和尹尚贤的搭档也让二人摘下最佳荧幕情侣。2010年4月尹恩惠客串韩国电视剧《个人取向》,与李民浩旧情难忘。同年6月成为由香港电影《甜蜜蜜》改编的电视剧《lovesong》的女主角,但由于同年6月底男主角突然离世,导致制作无限期中断；同年8月与Babyvox的4个姐姐在《金正恩的巧克力》节目中重新登台表演当年的组合名曲。2011年3月尹恩惠以《我的黑色小礼服》再次挑战大荧幕,演绎了韩国二十几岁时尚女性之间的友谊,爱情和生活；同年5月与姜志焕主演韩国SBS电视台电视剧《对我说谎试试》。2012年3月,尹恩惠就读于韩国中央大学高科技影像研究生院影像学系；同年9月她以导演身份带着导演处女作《织》入围釜山国际电影节韩国短篇竞赛单元,并受邀担任第十届“亚洲国际短篇电影节”短片形象奖竞赛单元特别评审委员；同年11月凭借与朴有天主演2012MBCTV水木剧《想你》获得2012年度韩国MBC演技大赏中“最佳人气女演员”和“韩流明星奖”。2013年8月出演韩国KBS电视台月火剧《未来的选择》,在剧中尹恩惠多变的造型受到观众的喜爱；同年,获得韩流十周年大赏电视剧女子部门大赏。2014年5月,尹恩惠时隔三年重返大荧幕,友情价无片酬出演《许三观卖血记》,原作中“林芬芳”这一角色；同年9月,个人经纪公司THEHOUSECOMPANY正式更名为JarmyEntertainment；同年10月,首届“中韩青年梦享微电影展”在北京拉开帷幕,韩国女星尹恩惠是此次电影展的韩方形象大使；同年11月,尹恩惠做出了首次执导MV的挑战,参与了新人乐队Dear.me的主打歌《一步一步》和收录歌曲《Dear.me》的MV制作；尹恩惠出演中韩合拍电影《思念爱》女一号“恩红”。2015年1月,根据余华同名小说改编的电影《许三观卖血记》在韩国上映,饰演100公斤的农村姑娘；4月下旬,加盟由东方卫视打造的综艺节目《女神的新衣》第二季。8月,首次成为冠军女神。2016年,加盟中国版《王子咖啡店》。2020年9月,与孔刘,李善均,蔡贞安,金东旭,金财昱等主演MBC青春纪录片《咖啡王子1号店》。
2003年,担任韩国红十字会宣传大使2004年,担任大韩航空形象大使2005年,担任“信息网络乡村”宣传大使,担任韩国戏剧节宣传大使2006年,担任三星企业形象大使2007年,“天使的信”慈善写真--关注遗弃儿童,实现愿望--与尹恩惠一起帮助病患儿童“天使的信”2008年,“美丽的眼睛”慈善捐赠会,“重建希望”国际儿童后援计划--柬埔寨水井建设,“粉红丝带”乳腺癌防治活动2009年,Make-A-Wish--与尹恩惠一起帮助病患儿童战胜病魔,“loveyourw”乳腺癌防治活动,“与尹恩惠一起珍视能源”为冬季贫困儿童送温暖筹款活动2010年,“与盲童共筑希望”宣传大使,帮助少女家长“pinkwings”宣传活动,帮助非洲儿童“neveralone”宣传互动,2010年“loveyourw”乳腺癌基金捐款活动,“hopeangel”绝症儿童基金筹集活动,“卡地亚loveday”慈善照片展2011年“loveyourw”乳腺癌基金捐款活动,“Cartierlove”慈善展示会2011年3月,尹恩惠确认牵手国际高档护肤及化妆品品牌雅姿,以该品牌美白系列产品中国区代言人身份全面进军中国市场；同年8月,尹恩惠和阮经天被邀请为金立智能手机e-life系列的最新形象代言人。2012年,“希望之路大长征RoadforHope”马达加斯加,“sharehappiness”慈善拍卖会,《想你》制作发表会为了营养不良的儿童你先捐献应援大米2013年,“希望之路大长征”马达加斯加尹恩惠希望中心竣工,通过《ohmystar》参与了为未婚妈妈加油的节目,《未来的选择》开播应援大米捐助给饥饿对策委员会使用2013年4月受邀出席了在越南河内举行的巴宝莉开业活动,且成为首次登上《时尚芭莎》越南版的韩国明星；同年5月,世界化妆品牌MAC选择了2012年时所有大韩民国女性的美容指标,创造了“热粉色口红综合症”的主人公尹恩惠作为其代言人；2014年,“中韩青年梦享微电影展”的韩方形象大使,“7by7义卖会”为独居老人分享祝福,录制饥饿对策广播广告,2014年9月,尹恩惠在首尔新沙洞Jacob'sLadder卖场举行慈善义卖,捐赠自己之前的收藏品,本次义卖会的全部收入都将会用在帮助少年少女家庭以及残疾人等社会的部分弱势群体中；2015年,KuhoHeartForEye活动,2015年4月,正式出任巴黎欧莱雅品牌首位亚洲区代言人；